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发布日期:2023-03-06 21:02:51

一、 系统软件资源

 

操作系统

 Linux CentOS 7.5 64bit

作业调度

 Slurm 17.02

 gcc 4.8.5 intel compiler 20202018OneAPI

 Intel MKL 2020FFTW3 3.10OpenblasBlas

并行环境

 Intel MPI 2020OpenMPIMpich等并行环境

GPU环境

 CUDA 11.4

 

二、应用软件资源

 

序号

软件名

版本

简介

适合学科

1

MATLAB

2019b

MATLAB是美国MathWorks公司出品的商业数学软件,用于算法开发、数据可视化、数据分析以及数值计算的高级技术计算语言和交互式环境

数学、统计学、计算机科学技术等

2

OpenFOAM

5.x

一个完全由C++编写,在linux下运行,面向对象的计算流体力学(CFD)类库

力学、物理学等

3

ABINIT

7.10.1

ABINIT程序包是基于密度泛含理论(Density   Functional Theory, DFT),采用赝势和平面波基矢的方法来处理由电子和核所组成的体系(分子和具有周期性结构的固体),它可以计算体系的总能、电荷密度以及电子结构。

化学、化学工程等

3

GROMACS

2016.3

GROMACS是一个功能强大的分子动力学的模拟软件,其在模拟大量分子系统的牛顿运动方面具有极大的优势。GROMACS是用于研究生物分子体系的分子动力学程序包。

生物学等

4

NAMD

2.12

NAMDNAnoscale   Molecular Dynamics)是用于在大规模并行计算机上快速模拟大分子体系的并行分子动力学代码。

化学、化学工程等

5

WRF

3.9

WRF是指The Weather   Research and Forecasting Model,即天气预报模式,被誉为是次世代的中尺度天气预报模式。

物理、地球科学、航天航空科学技术等

6

Nwchem

6.6

NWChem是运行在高性能并行超级计算机和通常工作站集群上的计算化学软件,可以用在大多数计算平台上

化学等

7

BLAST

2.2.9

BLASTBasic Local Alignment   Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具

生物学等

8

DL_POLY

1.1

DL_POLY是串行和并行分子动力学模拟软件包。DL_POLY目前有两个版本。DL_POLY_2是原始版本,用复制数据的方法并行化,适用于在100个处理器上模拟三万个原子的情况;DL_POLY_3的并行化使用区域分解,适用于在81024个处理器上,模拟百万量级的原子。对于一个DL_POLY许可,同时提供两个版本。DL_POLY还提供基于JAVA语言的图形用户界。

力学、物理学等

9

IDL

8.6

IDL使用者可以迅速且方便地运用此软件将数据转换为图像,促进分析和理解。通过软件转化的图像既可以是简单色彩,也可以是全色三维图像和模型。

数学、物理学等

10

Mathematica

11.2

Mathematica是一款科学计算软件,很好地结合了数值和符号计算引擎、图形系统、编程语言、文本系统、和与其他应用程序的高级连接。很多功能在相应领域内处于世界领先地位,它也是使用最广泛的数学软件之一。

数学、物理学等

11

MathGL

2.4.4

 

数学、物理学等

12

GNU Scientific Library(GSL)

2.5

 

数学、物理学等

13

emacs

28.2

 

数学、物理学等

14

Eigen

3.4.0

 

数学、物理学等

15

metis

0.7.2

 

数学、物理学等

16

petsc

3.18.2

 

数学、物理学等

17

parmetis

4.0.3

 

数学、物理学等

18

hypre

 

 

数学、物理学等

19

boost

1.80.0

 

数学、物理学等

20

scalapack

2.2.0

 

数学、物理学等

21

SuperLU

5.3.0

 

数学、物理学等

 

 

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